The X-Men stripovi imaju mnoge različite priče i timovi radeći zajedno na zaštiti svijeta od raznih prijetnji. Međutim, nakon desetljeća u objavljivanju, pitanja koja dovode u pitanje kontinuitet franšize gotovo će zasigurno nastati. Isto se može primijeniti i na X-Men filmovi objavljeni od 2000. do 2020., posebno s jednom određenom scenom iz 2006. godine X-Men: Posljednji stalak.
U filmu je profesor X (kojeg glumi Patrick Stewart) prisiljen suočiti se sa svojom najtežom pogreškom u obliku Jean Greya (glumi ga Famke Janssen) i njezine transformacije u Mračni Feniks. Nakon godina zadržavanja Jean-ove nepremostive psihičke moći, oni su se očitovali kao mračna osobnost koja je zrcalila njezinog komičnog kolegu. Jedna velika razlika između njih dvojice događa se na pola puta Posljednje uporište , međutim: Jean ubija profesoricu u njezinu domu iz djetinjstva. Publika je mislila da je ovo za profesora X značilo kraj, ali njegova priča tu nije završila.
Od svih neobičnih zapleta koje je X-Men ponuđenih filmova, najtajanstveniji je bio ušuškan u scenu nakon kredita u Posljednje uporište , koja je otkrila da je profesor preživio prenoseći svoju svijest u um čovjeka u komi. Doktorica Moira MacTaggert (glumi je Olivia Williams) otkrila je tajnu preživljavanja profesora X. Iako je linija ranije u filmu objašnjavala ideju, misterija Xavierovog povratka nikada nije u potpunosti objašnjena ili čak spomenuta u sljedećim filmovima.
Publika će Charlesa Xaviera ponovno vidjeti tek 2013. godine Gorska kuna u sceni nakon kredita. U tom slijedu Logan se suočio licem u lice s profesorom i pitao kako je preživio. Charles je na prvi odgovorio povratnim pozivom X-Men film, navodeći: '[Niste] jedini s poklonima.' Ta usamljena izjava bila bi jedino objašnjenje za njegovo uskrsnuće tijekom nekoliko godina.
Prije nego što je Stewart posljednji put ponovio svoju ulogu profesora Logan , pojavio se 2014. godine X-Men: Days of Future Past , koji je također prikazao povratak mnogih klasičnih glumaca koji su se borili u ne tako dalekoj budućnosti protiv Sentinela. Mnogi su obožavatelji nagađali da je profesor X u nekom trenutku objasnio svoj povratak ostalima izvan ekrana, jer nitko od glumačke ekipe nije dovodio u pitanje njegov povratak iz gotovo sigurne smrti.
Iako mnoštvo teorija još uvijek pluta oko fandoma, tražeći alternativne načine na koje se Charles mogao vratiti, glavno objašnjenje je da je profesor izgledao poput sebe unatoč tome što je imao drugačije tijelo jer je komi bio njegov brat blizanac. Prije svoje smrti, Xavier je svoju svijest prenio u ovo drugo tijelo. Njegove fizičke mogućnosti ostaju iste jer, iako je imao novo tijelo, mišići nogu vjerojatno su bili jako atrofirani. Iako ovo objašnjenje nije najefikasnije u zapletu, čini se da redak koji spominje postupak ranije u filmu podupire teoriju.
Nažalost, jedna od najvećih misterija u X-Men filmovi - o uskrsnuću profesora X nakon što ga je ubio Dark Phoenix - nikada nisu dobili veliko objašnjenje koje je zaslužilo. Umjesto toga, uzeto je kao datost da publika neće previše duboko gledati tajnu. Sad kad Marvel Studios imaju prava, postoji nada da će njihov sljedeći izlazak na veliki ekran imati puno manje labavih niti radnje.
